More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0529 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  80.25 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  75.16 
 
 		 157 aa  244  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 157 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 157 aa  236  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  68.79 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  67.53 
 
 		 157 aa  216  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.53 
 
 		 156 aa  156  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  54 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  52.59 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.8 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  51.11 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 153 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 168 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50.37 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  51.47 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  47.37 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  43.23 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.79 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  51.49 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  42 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.79 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  44.85 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  43.87 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  42.67 
 
 		 177 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  43.79 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>