More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4169 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  40.76 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  45 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.14 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  44.53 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  46.09 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  40.13 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  37.34 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  39.49 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  40.56 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  41.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  42.34 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  41.67 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  40.85 
 
 		 172 aa  133  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  40.94 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  42.25 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  40.97 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  40.25 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  41.3 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  40.14 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  41.01 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  38.73 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  42 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  42.45 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  39.58 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  40.43 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  43.38 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  42.28 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  39.6 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  40.15 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  41.56 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  37.09 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>