More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0569 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0569  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909805  normal  0.26821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  76.43 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  75.16 
 
 		 157 aa  244  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  70.06 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 157 aa  229  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  69.43 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  66.24 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  63.12 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  56.64 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.23 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  49.38 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.94 
 
 		 153 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 167 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 172 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  49.07 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.75 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  50.72 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  49.69 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  51.82 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  48.43 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.06 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  44.1 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  44.1 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.82 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.53 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  49.26 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.52 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.08 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.87 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  45.57 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  47.44 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  45.96 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>