More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0775 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  100 
 
 		 148 aa  292  8e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  60.14 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  61.97 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  58.04 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  57.34 
 
 		 172 aa  176  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  61.54 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  61.43 
 
 		 144 aa  173  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  59.44 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  173  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  58.22 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  58.04 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  57.34 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  59.03 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  58.74 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  58.9 
 
 		 159 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  59.44 
 
 		 154 aa  169  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  56.85 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  57.34 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  58.9 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2719  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.505154  normal  0.650431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  156  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 156 aa  156  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  53.96 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  52.48 
 
 		 158 aa  151  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 159 aa  151  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 172 aa  150  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 162 aa  147  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  46.94 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.32 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0358  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 160 aa  141  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0325  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.36 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  50 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0033  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  137  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3903  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>