More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1603 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  59.31 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  56.94 
 
 		 161 aa  159  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  56.43 
 
 		 171 aa  157  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  54.35 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  153  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  52.52 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  52.48 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  50 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  47.22 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1018  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 155 aa  144  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 182 aa  143  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  52 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  46.58 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  53.12 
 
 		 161 aa  140  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3903  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>