More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0655 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  100 
 
 
158 aa  313  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  71.34 
 
 
158 aa  229  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  72.97 
 
 
158 aa  226  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  66 
 
 
158 aa  207  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  66.89 
 
 
154 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  65.75 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  61.49 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  61.94 
 
 
157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  63.23 
 
 
158 aa  192  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  64.38 
 
 
155 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  62 
 
 
154 aa  192  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  63.09 
 
 
150 aa  191  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  63.51 
 
 
156 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  59.24 
 
 
157 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  61.64 
 
 
156 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  60.67 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  59.87 
 
 
155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
153 aa  180  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
155 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
155 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  60.27 
 
 
155 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  59.59 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  59.59 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  52.94 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  58.5 
 
 
154 aa  176  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.59 
 
 
155 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
157 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  58.9 
 
 
155 aa  174  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  55.77 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  54.84 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  57.53 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.11 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  58 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  59.86 
 
 
151 aa  171  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  56.58 
 
 
156 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
155 aa  168  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  56.76 
 
 
159 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
154 aa  168  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
154 aa  168  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  58.33 
 
 
154 aa  168  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  56.16 
 
 
160 aa  167  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
152 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  54.05 
 
 
156 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  54.05 
 
 
156 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  57.64 
 
 
155 aa  164  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
154 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.66 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  53.42 
 
 
172 aa  160  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
160 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  51.92 
 
 
165 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  56.46 
 
 
150 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  56.46 
 
 
150 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  53.19 
 
 
151 aa  160  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
152 aa  160  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  62.12 
 
 
153 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  47.06 
 
 
164 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.06 
 
 
162 aa  158  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  53.55 
 
 
168 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
151 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
167 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  53.55 
 
 
168 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  52.94 
 
 
165 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  55.24 
 
 
155 aa  158  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  53.55 
 
 
168 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  48.37 
 
 
164 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
165 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  53.02 
 
 
161 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
162 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
159 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  53.38 
 
 
159 aa  157  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
171 aa  157  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  53.85 
 
 
148 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
166 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
153 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  49.3 
 
 
165 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  53.06 
 
 
154 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.66 
 
 
160 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  53.02 
 
 
157 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  51.7 
 
 
151 aa  154  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
165 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  52.35 
 
 
159 aa  153  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
150 aa  153  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  48.34 
 
 
155 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  51.7 
 
 
172 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  52.29 
 
 
157 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
160 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  51.66 
 
 
159 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  49.34 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  52.7 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>