More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0771 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  59.03 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 172 aa  167  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 154 aa  166  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  56.25 
 
 		 151 aa  164  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  54.48 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  56.64 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  53.19 
 
 		 161 aa  159  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  55.1 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 162 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 159 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1756  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.941289  normal  0.680146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 157 aa  146  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  146  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 161 aa  146  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4733  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4599  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432881  normal  0.0841371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2757  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2005  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2546  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4734  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.683241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1198  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 189 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3632  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.865786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4203  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 160 aa  141  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0698  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  hitchhiker  0.0000324101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>