More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1629 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  64 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  65.97 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  65.33 
 
 		 152 aa  191  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  57.33 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 153 aa  176  8e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  60.27 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  60.27 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  60.27 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0060  SsrA-binding protein  60 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  52.41 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  50 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  43.45 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1520  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1756  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.941289  normal  0.680146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4733  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4599  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432881  normal  0.0841371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1463  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0677616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4734  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.683241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0698  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  hitchhiker  0.0000324101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2436  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  47.71 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_16021  predicted protein  43.24 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.521633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1426  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 150 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2546  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3374  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>