More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16021 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_16021  predicted protein  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.521633  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15922  predicted protein  89.11 
 
 		 102 aa  182  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00347637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  51.57 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  45.81 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  41.33 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  45.1 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  45.73 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  50 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  44.87 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  43.59 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  43.23 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  44.23 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1576  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  42 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  40.54 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 157 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  45 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  41.33 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  38.51 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  41.45 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  41.56 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  42.66 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  43.71 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  39.87 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  42.18 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  41.03 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  38.62 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  42.31 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  39.6 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  41.77 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  39.6 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  38.93 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2057  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00464392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  43.31 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  42.18 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  45 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  41.78 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  41.67 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  42.18 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  39.1 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  40.54 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  39.46 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  39.87 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  38.56 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>