More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1576 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1576  SsrA-binding protein  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50.71 
 
 		 155 aa  148  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 150 aa  143  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  49.61 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.71 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  49.3 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  45 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  40.69 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  43.42 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  43.42 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 177 aa  123  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_16021  predicted protein  47.59 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.521633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4169  SsrA-binding protein  40.54 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.496394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  48.91 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  41.5 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  41.96 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 165 aa  120  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  42.18 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>