More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1709 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  100 
 
 		 164 aa  330  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  95.12 
 
 		 164 aa  318  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  94.51 
 
 		 164 aa  315  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  88 
 
 		 165 aa  274  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  63.19 
 
 		 166 aa  200  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  62.68 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  62.68 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  63.01 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 154 aa  193  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  61.64 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  53.95 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 155 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.29 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  54.25 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  55.92 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  55.92 
 
 		 155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  55.24 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  51.72 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  51.32 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45.03 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  43.59 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1282  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0727299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.67 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 157 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3690  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0581968  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1239  SsrA-binding protein  44.65 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1407  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 151 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1094  SsrA-binding protein  46 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.146996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2388  SsrA-binding protein  43.95 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  51.15 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1268  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.745549  normal  0.12571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>