More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1248 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  296  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  99.33 
 
 		 150 aa  296  9e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  98.67 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  79.73 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  72.48 
 
 		 150 aa  215  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  70.27 
 
 		 151 aa  213  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 153 aa  203  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0060  SsrA-binding protein  71.14 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  59.59 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  60.27 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2049  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1277  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.622701 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2032  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.17643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2558  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1303  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.840826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5309  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0732663  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2435  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.0945366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2032  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.148914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1590  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  47.79 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  47.86 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  41.38 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1520  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 167 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 160 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1616  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.823656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  39.73 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  40.41 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2436  SsrA-binding protein  43.45 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1463  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0677616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 165 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  43.62 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1301  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.928696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0959  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>