More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1111 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1111  SsrA-binding protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0695  SsrA-binding protein  71.14 
 
 		 150 aa  228  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0712  SsrA-binding protein  71.62 
 
 		 151 aa  222  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0060  SsrA-binding protein  72.48 
 
 		 151 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0617  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.412585  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1248  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 150 aa  203  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1123  SsrA-binding protein  67.79 
 
 		 150 aa  203  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1060  SsrA-binding protein  66.89 
 
 		 152 aa  200  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  59.18 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  50 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1754  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  43.14 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  44.74 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  47.71 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.37 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1203  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.386062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  43.05 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5488  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2342  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.994349  normal  0.13276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  43.48 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1616  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.823656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1145  SsrA-binding protein  41.22 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.533821  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63060  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.976463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 157 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1520  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  43.92 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 152 aa  123  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1463  SsrA-binding protein  43.84 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0677616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2436  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  43.42 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1756  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.941289  normal  0.680146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1256  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0547561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>