More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0348 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 160 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  150  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.7 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  52.55 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  46.53 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 155 aa  141  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 156 aa  141  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 152 aa  141  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 155 aa  139  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.49 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 158 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50.38 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0938  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0096  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1629  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 177 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6841  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 172 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0867  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.609087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  44 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  45.58 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>