More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1438 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  61.69 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  54.23 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  52.55 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  49.34 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  47.13 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.37 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  45.81 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0524  SsrA-binding protein  47.06 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00169636  normal  0.364367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  48.95 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  47.92 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 182 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  45.81 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  45.81 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 155 aa  137  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  43.95 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 158 aa  135  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl210  SsrA-binding protein  51.8 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.021632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  44.16 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.71 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  52.17 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0348  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  48.63 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  45.71 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>