More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3480 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  100 
 
 		 152 aa  309  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  74.17 
 
 		 153 aa  232  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  59.71 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  56 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  57.25 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  50 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  53.52 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  51.45 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.03 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  44.53 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.92 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.2 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  43.45 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 155 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.78 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  48.18 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  47.45 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1438  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  44.78 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  44.78 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  44.2 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  41.33 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  42 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  41.33 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  42 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  42.96 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>