More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0162 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  59.71 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  57.45 
 
 		 153 aa  169  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  58.27 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  56.74 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  52.31 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  44.14 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  44.3 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  44.67 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  42.95 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  40.79 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  51.09 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  43.59 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.27 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  45.03 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  45.03 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  43.71 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  40.79 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  42.68 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  40.79 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  43.57 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.48 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  43.14 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  42.28 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  43.14 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  43.26 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  48.12 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  43.66 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  45 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  44.29 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  44.68 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  45.89 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  40.27 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  40.71 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2766  SsrA-binding protein  43.54 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  43.62 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0033  SsrA-binding protein  42.07 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  42.55 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  40.85 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  39.6 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  42.11 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  38.78 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  38.1 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>