More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1272 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1272  SsrA-binding protein  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  66.67 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  61.33 
 
 		 155 aa  201  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05540  SsrA-binding protein  56.29 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.6408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  163  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  46.88 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50.32 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  53.25 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  52.32 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  49.01 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.99 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  48.05 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  48 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  51.01 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.98 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.87 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  46.71 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.99 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.75 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.13 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  43.87 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  48.67 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 155 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  46.36 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  44.22 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.71 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4203  SsrA-binding protein  47.13 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  47.68 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.45 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  49.35 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  50.31 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43050  SsrA-binding protein  47.2 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.490843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  47.37 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4515  SsrA-binding protein  46.5 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20300  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.493678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  46.41 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2876  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>