More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0624 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  32.33 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  32.83 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  31.82 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  31.79 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  31.79 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  32.62 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  31.69 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1870  RpiR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  0.341017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4429  RpiR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.882405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  24.69 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  25.49 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  28.82 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  20.47 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  26.74 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  25.62 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  25.85 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  24.22 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  25.97 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  22.94 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  22.18 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  28.92 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  27.07 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2002  RpiR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1528  transcriptional regulator, RpiR family  25.99 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  26.07 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  27.24 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.87 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  24.54 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  25.89 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1522  transcriptional regulator, RpiR family  27.85 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  27.49 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  24.42 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0959  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.396174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  27.31 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  30.17 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  28.2 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6227  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  26.53 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1541  transcriptional regulator  24.33 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  21.34 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5399  RpiR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5350  RpiR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  24.42 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>