More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2349 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 
254 aa  516  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
254 aa  516  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  80.89 
 
 
253 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3662  transcriptional regulator, RpiR family  29.2 
 
 
251 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.078396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  28.16 
 
 
249 aa  102  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  26.81 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  26.23 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06356  glucokinase  28.04 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2747  RpiR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0592883  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  27 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  27.83 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4203  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.75 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.24 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  24.51 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  25.98 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1059  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.79 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629947  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1021  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.79 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1019  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.28 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150266  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  23.74 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  25.6 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1119  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.44 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1299  Hex regulon repressor  25.44 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.776105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
297 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  25.42 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.8 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6622  transcriptional regulator, RpiR family  24.16 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360305  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  25.43 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  24.12 
 
 
242 aa  62.4  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6249  transcriptional regulator RpiR family  24.55 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  25 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  23.36 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1678  transcriptional regulator  30.58 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00566045  normal  0.0111544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  26.03 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  23.91 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  22.07 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.44 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5679  transcriptional regulator, RpiR family  24.16 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.1 
 
 
282 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.07 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02030  transcriptional regulatory protein HexR  27.59 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  28.46 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.11 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  21.27 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  24.56 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.66 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3319  RpiR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  23.86 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  26.5 
 
 
289 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.24 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.66 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0147  transcriptional regulator  25.12 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.66 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5064  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  25.54 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.55 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
281 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
338 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  23.58 
 
 
311 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3144  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.29 
 
 
289 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0232322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.27 
 
 
289 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.78 
 
 
285 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  22.27 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.27 
 
 
301 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
293 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
320 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.78 
 
 
288 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  22.6 
 
 
287 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.27 
 
 
301 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.14 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  22.97 
 
 
320 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.98 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  22.83 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>