280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4058 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3832  RpiR family transcriptional regulator  50 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.918154  normal  0.315184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  25.94 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  22.73 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  28.78 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  28.78 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  29.39 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.52 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  28.14 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  29.03 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  28.12 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  26.94 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  25.26 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  25.29 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2753  transcriptional regulator, RpiR family  30.36 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  26.79 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3346  transcriptional regulator, RpiR family  26.21 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3702  RpiR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3669  transcriptional regulator, RpiR family  25.81 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2002  RpiR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3484  RpiR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1414  hypothetical protein  27.96 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.983802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  25.19 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0081  hypothetical protein  25.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4614  transcriptional regulator, RpiR family  24.73 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  26.29 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2822  RpiR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  26.95 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  26.55 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  25.82 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  28.38 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3998  transcriptional regulator, RpiR family  23.5 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  22.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1870  RpiR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  0.341017 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  20.72 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  24.51 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>