More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1910 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  80.89 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3662  transcriptional regulator, RpiR family  30.4 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.078396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0456  transcriptional regulator, RpiR family  28.98 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  30.21 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  25.4 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  25.78 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.2 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.8 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  27.43 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.39 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.05 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  25.55 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  24.54 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  24.68 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  25.6 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2747  RpiR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0592883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  28.93 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  24.66 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.54 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06356  glucokinase  24.3 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  24.76 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.58 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  26.83 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  20.45 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  24.48 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  23.74 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  20.45 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6622  transcriptional regulator, RpiR family  23.6 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360305  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.02 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  23.36 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4203  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.21 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.73 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  26.46 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  20.45 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  20.45 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3618  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.73 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.73 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0416  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  22.9 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  22.74 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  25.21 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1299  Hex regulon repressor  23.04 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.776105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1119  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.04 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1059  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.74 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1021  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.74 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1019  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.74 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  24.23 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1556  putative transcription regulation repressor HEXR transcription regulator protein  23.96 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  26.67 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  24.57 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01243  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.08 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>