More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31136 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31136  predicted protein  100 
 
 
371 aa  758    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  39.9 
 
 
320 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2414  dihydrouridine synthase, DuS  38.3 
 
 
314 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  45.76 
 
 
351 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0864  nifR3 family TIM-barrel protein  44.63 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  41.95 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0534  NifR3 family TIM-barrel protein  36.63 
 
 
346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1847  dihydrouridine synthase DuS  39.02 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323112  normal  0.104761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1786  dihydrouridine synthase DuS  36.71 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000927227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1813  nifR3 family TIM-barrel protein  34.95 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3192  dihydrouridine synthase, DuS  40.68 
 
 
342 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  37.34 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2338  putative tRNA-dihydrouridine synthase C, DuS  38.87 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135158  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
324 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
324 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1779  TIM-barrel protein, nifR3 family  43.54 
 
 
397 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.081766  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.47 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  35.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  35.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  35.12 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1303  NifR3/Smm1 family protein  35.09 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0734085 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  39.43 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  34.3 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0506  NIFR3-like protein  40.09 
 
 
356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973131  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0906  NifR3/Smm1 family protein  36.02 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  35.12 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  32.79 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  32.79 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  35.12 
 
 
332 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1351  dihydrouridine synthase, DuS  38.84 
 
 
324 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10981  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  38.82 
 
 
335 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1501  dihydrouridine synthase DuS  33.82 
 
 
319 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2521  tRNA-dihydrouridine synthase C  36.59 
 
 
312 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2364  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.77 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2409  tRNA-dihydrouridine synthase C  36.07 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.021708  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3425  dihydrouridine synthase, DuS  40 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2413  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.77 
 
 
312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4632  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.22 
 
 
352 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2242  dihydrouridine synthase, DuS  36.29 
 
 
309 aa  129  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000197491  hitchhiker  0.000869385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2320  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.77 
 
 
331 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10981  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  38.82 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1255  dihydrouridine synthase, DuS  41.35 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0939064  normal  0.0146388 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10941  nitrogen regulation protein NifR3 family-like protein  38.82 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48953  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  34.16 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2808  tRNA-dihydrouridine synthase C  34.98 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0382  TIM-barrel protein, nifR3 family  39.17 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0397  TIM-barrel protein, nifR3 family  39.17 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1337  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.77 
 
 
309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2887  tRNA-dihydrouridine synthase C  34.98 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  35.68 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1355  tRNA-dihydrouridine synthase C  34.98 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15198  hitchhiker  0.0054814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0048  nifR3 family TIM-barrel protein  43.23 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11245  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2388  dihydrouridine synthase, DuS  36.6 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0313315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0429  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  38.71 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  0.096876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2731  NifR3 family TIM-barrel protein  37.63 
 
 
333 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00411092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2287  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.87 
 
 
315 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  40.91 
 
 
350 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1019  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  38.24 
 
 
335 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3266  tRNA-dihydrouridine synthase C  34.27 
 
 
316 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0659452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02307  NifR3/Smm1 family protein  36.17 
 
 
312 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2343  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.44 
 
 
328 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2859  dihydrouridine synthase, DuS  36.29 
 
 
308 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  hitchhiker  0.0000000322781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2083  TIM-barrel protein, nifR3 family  40.68 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2622  dihydrouridine synthase DuS  36.71 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0113547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2581  dihydrouridine synthase DuS  36.17 
 
 
317 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.601403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1583  dihydrouridine synthase DuS  37.7 
 
 
326 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.018372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0489  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  38.64 
 
 
356 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1762  dihydrouridine synthase DuS  36.17 
 
 
317 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0181198  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1544  dihydrouridine synthase DuS  39.27 
 
 
323 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.177604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1998  dihydrouridine synthase DuS  38.17 
 
 
336 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.774292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02069  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.87 
 
 
315 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1518  dihydrouridine synthase DuS  33.87 
 
 
315 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1508  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.87 
 
 
315 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2274  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.87 
 
 
315 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3665  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  39.2 
 
 
337 aa  126  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2928  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.08 
 
 
310 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02028  hypothetical protein  33.87 
 
 
315 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1130  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  39.44 
 
 
356 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353247  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1512  dihydrouridine synthase DuS  38.06 
 
 
323 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0251677  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1981  NifR3/Smm1 family protein  38.52 
 
 
323 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0473795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2279  dihydrouridine synthase, DuS  35.9 
 
 
314 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2429  tRNA-dihydrouridine synthase C  33.87 
 
 
315 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  44.22 
 
 
346 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0626  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.65 
 
 
326 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1533  tRNA-dihydrouridine synthase C  35.08 
 
 
310 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1525  nifR3 family TIM-barrel protein  33.47 
 
 
320 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2697  dihydrouridine synthase DuS  36.29 
 
 
315 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0155722  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1635  hypothetical protein  36.8 
 
 
326 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.270741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1088  nifR3 family TIM-barrel protein  35.78 
 
 
337 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3779  dihydrouridine synthase, DuS  38.78 
 
 
323 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.605744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2551  NifR3 family TIM-barrel protein  40.62 
 
 
357 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.344775  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1563  NifR3 family TIM-barrel protein  38.55 
 
 
356 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.526458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2368  TIM-barrel protein, nifR3 family  44.22 
 
 
336 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2307  dihydrouridine synthase, DuS  34.29 
 
 
340 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.936931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2418  TIM-barrel protein, nifR3 family  44.22 
 
 
336 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2221  tRNA-dihydrouridine synthase  40.68 
 
 
334 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0247  TIM-barrel protein, nifR3 family  38.73 
 
 
322 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0897176  normal  0.676091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>