138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2264 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  100 
 
 		 797 aa  1612    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  100 
 
 		 797 aa  1612    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  100 
 
 		 797 aa  1612    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  38.81 
 
 		 806 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 803 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  37.18 
 
 		 827 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5286  putative DNA integrase/recombinase  34.12 
 
 		 650 aa  257  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2148  hypothetical protein  38.59 
 
 		 518 aa  206  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5291  hypothetical protein  47.56 
 
 		 223 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  25.87 
 
 		 744 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3257  hypothetical protein  36.86 
 
 		 354 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  0.371735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  25.8 
 
 		 491 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 663 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  25.64 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  21.92 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.32 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3533  hypothetical protein  32.24 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.401883  normal  0.19863 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  22.98 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  22.98 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  22.98 
 
 		 737 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 637 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 630 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  24.05 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.55 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.06 
 
 		 300 aa  55.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 		 304 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  27.96 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  27.89 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  29.59 
 
 		 297 aa  52.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  35.71 
 
 		 329 aa  52.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 		 323 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25 
 
 		 286 aa  51.6  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  21.72 
 
 		 517 aa  52  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.14 
 
 		 299 aa  51.6  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  50.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.36 
 
 		 308 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 312 aa  50.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.18 
 
 		 307 aa  50.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 324 aa  50.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  30.99 
 
 		 345 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.95 
 
 		 300 aa  50.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  25.86 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 647 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 647 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  24.22 
 
 		 647 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.88 
 
 		 306 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 324 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 		 329 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  33.33 
 
 		 322 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 322 aa  48.9  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.67 
 
 		 300 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 		 330 aa  48.5  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 295 aa  48.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 324 aa  48.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  29.46 
 
 		 323 aa  48.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  36.07 
 
 		 436 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  29.13 
 
 		 295 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 307 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.53 
 
 		 321 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 351 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.62 
 
 		 307 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.52 
 
 		 307 aa  47.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.07 
 
 		 313 aa  47.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  34.43 
 
 		 436 aa  47.8  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  25 
 
 		 739 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  23.16 
 
 		 309 aa  47.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  21.69 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  27.6 
 
 		 313 aa  47.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  25.44 
 
 		 307 aa  47  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  24.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 311 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  23.12 
 
 		 328 aa  46.6  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  23.04 
 
 		 310 aa  46.6  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 311 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  23.2 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  23.2 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  22.27 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.05 
 
 		 308 aa  47  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  23.2 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  27.53 
 
 		 324 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  30.09 
 
 		 317 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31.49 
 
 		 343 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>