246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0992 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  94.3 
 
 		 803 aa  1496    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  100 
 
 		 806 aa  1652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  38.36 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  38.36 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  38.36 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  36.28 
 
 		 827 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5286  putative DNA integrase/recombinase  34.8 
 
 		 650 aa  258  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5291  hypothetical protein  42.69 
 
 		 223 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  25.92 
 
 		 744 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2148  hypothetical protein  32.43 
 
 		 518 aa  144  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3257  hypothetical protein  33.67 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  0.371735 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  27.27 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  29.81 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  24.56 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.73 
 
 		 301 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  34.02 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  34.02 
 
 		 322 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  36.71 
 
 		 328 aa  56.6  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 637 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 317 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 637 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0113  resolvase  36.71 
 
 		 258 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.89 
 
 		 277 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 344 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0055  resolvase  27.72 
 
 		 237 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  37.65 
 
 		 323 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  28.32 
 
 		 608 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  28.32 
 
 		 608 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  28.32 
 
 		 608 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  27.84 
 
 		 701 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  27.84 
 
 		 684 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  31.96 
 
 		 319 aa  52  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 303 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  32.97 
 
 		 298 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4323  phage integrase family protein  35 
 
 		 257 aa  51.6  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.980189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  35 
 
 		 298 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 309 aa  51.2  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  34.48 
 
 		 316 aa  51.2  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  50 
 
 		 299 aa  51.2  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  45.28 
 
 		 310 aa  51.2  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 		 306 aa  51.2  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 302 aa  51.2  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  37.93 
 
 		 268 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.72 
 
 		 284 aa  50.8  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  25.86 
 
 		 304 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0033  Rsd  39.29 
 
 		 260 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.945608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 298 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 300 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0014  resolvase  40 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.921027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.64 
 
 		 307 aa  50.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  31.91 
 
 		 373 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 308 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 353 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  25.66 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 324 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  25.66 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0031  resolvase  40 
 
 		 259 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131142  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4520  phage integrase family protein  44.83 
 
 		 400 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  52.78 
 
 		 443 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  32.97 
 
 		 308 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  38.1 
 
 		 304 aa  49.3  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 331 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.34 
 
 		 329 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  26.18 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  43.08 
 
 		 295 aa  49.3  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 300 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  58.97 
 
 		 309 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 303 aa  48.9  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 305 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30 
 
 		 305 aa  48.9  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  43.4 
 
 		 311 aa  48.9  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0993  phage integrase family protein  44.83 
 
 		 400 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 304 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  32.88 
 
 		 301 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.55 
 
 		 309 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 316 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  32.98 
 
 		 309 aa  48.5  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0038  resolvase  37.5 
 
 		 268 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 302 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  38.27 
 
 		 329 aa  48.5  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0056  phage integrase family protein  40 
 
 		 332 aa  48.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.73 
 
 		 298 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  39.13 
 
 		 309 aa  48.5  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.16 
 
 		 351 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 302 aa  48.5  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 295 aa  48.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  25.2 
 
 		 332 aa  48.1  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.73 
 
 		 298 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 303 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  38.16 
 
 		 309 aa  47.8  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.73 
 
 		 313 aa  47.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>