More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4644 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  100 
 
 		 637 aa  1298    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  56.43 
 
 		 637 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  36.33 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  36.33 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  36.33 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  28.85 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  28.85 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  28.5 
 
 		 608 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  27.21 
 
 		 638 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 630 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  32.56 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  32.56 
 
 		 617 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  27.01 
 
 		 637 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  28.33 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.55 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  30.17 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  25.75 
 
 		 701 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  25.75 
 
 		 684 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 295 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  26.4 
 
 		 675 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  34.29 
 
 		 310 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  25.3 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  22.95 
 
 		 708 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 298 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  32.74 
 
 		 313 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  33.14 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.99 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.54 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.98 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.05 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 296 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.81 
 
 		 307 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.6 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.42 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.83 
 
 		 307 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0587  site-specific recombinase, phage integrase family  23.54 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  30.11 
 
 		 304 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.17 
 
 		 298 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  32.46 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.88 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.64 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25.82 
 
 		 292 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  33.68 
 
 		 306 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 302 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 302 aa  77  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.61 
 
 		 311 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 311 aa  77  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  31.77 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.57 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.56 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.35 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  31.75 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  34.25 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  30.57 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  28.11 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  23.2 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>