20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0587 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  87.96 
 
 		 534 aa  952    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTO_A0072  phage integrase family site specific recombinase  96.77 
 
 		 713 aa  1424    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0587  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 713 aa  1466    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0087  phage integrase family site specific recombinase  80.34 
 
 		 721 aa  1189    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  23.54 
 
 		 637 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 637 aa  67  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  21.41 
 
 		 608 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  22.49 
 
 		 638 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  21.41 
 
 		 608 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  21.41 
 
 		 608 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  23 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  23 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  23.72 
 
 		 827 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 724 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 724 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 724 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 724 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>