56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3610 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  100 
 
 		 827 aa  1673    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 803 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  36.28 
 
 		 806 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5286  putative DNA integrase/recombinase  33.28 
 
 		 650 aa  270  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5291  hypothetical protein  41.82 
 
 		 223 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  31.06 
 
 		 744 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3257  hypothetical protein  29.79 
 
 		 354 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal  0.371735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2148  hypothetical protein  28.03 
 
 		 518 aa  108  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  23.99 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  27.16 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  23.26 
 
 		 491 aa  55.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 663 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  23.26 
 
 		 426 aa  53.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTO_A0072  phage integrase family site specific recombinase  23.72 
 
 		 713 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  23.29 
 
 		 498 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  25.36 
 
 		 608 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  33.7 
 
 		 279 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  25.36 
 
 		 608 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  25.36 
 
 		 608 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  23.43 
 
 		 617 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  23.43 
 
 		 617 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0087  phage integrase family site specific recombinase  24.44 
 
 		 721 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0587  site-specific recombinase, phage integrase family  23.72 
 
 		 713 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277483  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.13 
 
 		 305 aa  47.8  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  36.84 
 
 		 322 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  33.33 
 
 		 328 aa  45.8  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 637 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  19.86 
 
 		 517 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  36.36 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4366  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.18 
 
 		 319 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 296 aa  44.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  44.62 
 
 		 328 aa  44.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  44.62 
 
 		 328 aa  44.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  28.49 
 
 		 325 aa  44.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.07 
 
 		 295 aa  44.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0675  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.18 
 
 		 319 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3786  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.14 
 
 		 325 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00278104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4075  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  32.14 
 
 		 325 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  26.51 
 
 		 322 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 724 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 724 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 724 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 724 aa  44.3  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>