More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1579 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  100 
 
 		 744 aa  1509    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0992  phage integrase family protein  25.92 
 
 		 806 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 803 aa  146  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 797 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 797 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 797 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  25.95 
 
 		 827 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5286  putative DNA integrase/recombinase  25 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  22.7 
 
 		 498 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  28.34 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  31.15 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  23.3 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  29.9 
 
 		 313 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 310 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  28.12 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  24.68 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  24.68 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.11 
 
 		 299 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 321 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 303 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 346 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  28.37 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 302 aa  55.8  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 309 aa  55.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.89 
 
 		 302 aa  55.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 328 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  27.27 
 
 		 308 aa  55.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 290 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  21.29 
 
 		 637 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 303 aa  55.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  29.1 
 
 		 313 aa  55.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 311 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.1 
 
 		 311 aa  54.3  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.5 
 
 		 299 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 308 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  23.22 
 
 		 637 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  27 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 336 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  19.79 
 
 		 491 aa  52.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 301 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 313 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  30.27 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 		 311 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5291  hypothetical protein  25.95 
 
 		 223 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 316 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 299 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 362 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 303 aa  52.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 310 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.91 
 
 		 304 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.02 
 
 		 308 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  30.46 
 
 		 337 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  27.53 
 
 		 295 aa  52  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  27.27 
 
 		 309 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  28.3 
 
 		 304 aa  51.6  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 305 aa  51.6  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 		 310 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  27.66 
 
 		 300 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.02 
 
 		 317 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 		 300 aa  51.6  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  31.43 
 
 		 331 aa  51.6  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  22 
 
 		 323 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  25.13 
 
 		 298 aa  51.2  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  22.22 
 
 		 426 aa  51.2  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 303 aa  51.2  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  26.84 
 
 		 317 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 309 aa  50.8  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 311 aa  50.8  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 318 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.53 
 
 		 321 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.55 
 
 		 314 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  27.75 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 302 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  26.18 
 
 		 328 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 721 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.23 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>