55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3903 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  100 
 
 		 724 aa  1474    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  100 
 
 		 724 aa  1474    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  100 
 
 		 724 aa  1474    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  100 
 
 		 724 aa  1474    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  63.78 
 
 		 719 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 739 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 741 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 741 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 741 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  33.7 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  26.35 
 
 		 637 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  29.37 
 
 		 630 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 737 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 721 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  28.57 
 
 		 721 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  31.75 
 
 		 491 aa  87.4  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  31.1 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  27.78 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  27.78 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  26.67 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  22.65 
 
 		 675 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  28.91 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  28.91 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  28.91 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  33.06 
 
 		 608 aa  52.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  33.06 
 
 		 608 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  33.06 
 
 		 608 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 647 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 647 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 647 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 376 aa  48.5  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 797 aa  47.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 797 aa  47.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 797 aa  47.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 637 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.27 
 
 		 309 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  26.53 
 
 		 638 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0587  site-specific recombinase, phage integrase family  28.9 
 
 		 713 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3610  integrase family protein  27.53 
 
 		 827 aa  44.3  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00523009  normal  0.0387105 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTO_A0072  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 713 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>