123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5578 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  100 
 
 
721 aa  1474    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  100 
 
 
721 aa  1474    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  100 
 
 
737 aa  1476    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  62.42 
 
 
491 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  64.85 
 
 
426 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  44.3 
 
 
663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  37.71 
 
 
498 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  31.11 
 
 
630 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  31.82 
 
 
637 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5435  hypothetical protein  72.46 
 
 
352 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  24.78 
 
 
675 aa  114  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  23.68 
 
 
708 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  30.17 
 
 
637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0068  integrase family protein  24.17 
 
 
461 aa  107  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  29.01 
 
 
637 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  30.75 
 
 
608 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  30.81 
 
 
608 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  30.81 
 
 
608 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  23.54 
 
 
701 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  23.54 
 
 
684 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3699  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0398005  normal  0.195076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1216  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324318  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3468  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00341973  normal  0.0358232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3741  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  0.164108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3043  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00307933  hitchhiker  0.00706888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3604  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0140825  normal  0.0766423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3586  integrase family protein  28.83 
 
 
719 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.186678  hitchhiker  0.00677249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0479  phage integrase family protein  28.57 
 
 
724 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0513  phage integrase family protein  33.04 
 
 
741 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3897  phage integrase family protein  28.57 
 
 
724 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3903  phage integrase family protein  28.57 
 
 
724 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5419  phage integrase family protein  33.04 
 
 
741 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5934  phage integrase family protein  28.57 
 
 
724 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1427  phage integrase family protein  32.32 
 
 
739 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5399  phage integrase family protein  33.04 
 
 
741 aa  92  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.558609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  30.82 
 
 
617 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  30.82 
 
 
617 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  27.42 
 
 
647 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  27.42 
 
 
647 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  27.42 
 
 
647 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  27.54 
 
 
638 aa  80.9  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1935  phage integrase  24.84 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3969  phage integrase family protein  24.84 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3804  phage integrase family protein  24.84 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0069  integrase family protein  21.85 
 
 
517 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4793  phage integrase family protein  23.4 
 
 
797 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2264  phage integrase family protein  23.4 
 
 
797 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2973  phage integrase family protein  23.4 
 
 
797 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  25.97 
 
 
309 aa  55.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  21.26 
 
 
303 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  27.05 
 
 
278 aa  55.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 
346 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  27.78 
 
 
291 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  23.49 
 
 
322 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1240  phage integrase  26.9 
 
 
330 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  27.6 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  21.88 
 
 
297 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0245  integrase family protein  29.94 
 
 
333 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  25 
 
 
292 aa  51.2  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.33 
 
 
317 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1579  integrase family protein  24.84 
 
 
744 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.415833  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  21.65 
 
 
290 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  23.58 
 
 
295 aa  49.7  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  23.4 
 
 
282 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1762  integrase family protein  25.29 
 
 
306 aa  49.3  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00191766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  26.77 
 
 
317 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  20.78 
 
 
298 aa  48.5  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  25.26 
 
 
283 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  26.74 
 
 
251 aa  48.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 
297 aa  47.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 
336 aa  48.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  22.08 
 
 
400 aa  47.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  22.08 
 
 
400 aa  47.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  20.59 
 
 
282 aa  47.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  26.23 
 
 
251 aa  47.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.71 
 
 
288 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  27.13 
 
 
304 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  29.53 
 
 
559 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  28.09 
 
 
364 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  24.76 
 
 
284 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  22.96 
 
 
400 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  29.53 
 
 
507 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 
294 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4521  phage integrase family protein  26.16 
 
 
803 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  27.65 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  20 
 
 
295 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  20 
 
 
295 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.5 
 
 
298 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  23.67 
 
 
292 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  23.67 
 
 
292 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  23.67 
 
 
292 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  23.67 
 
 
292 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  30.81 
 
 
286 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>