93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0438 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  755    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  83.12 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  72.08 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  69.53 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  69.64 
 
 		 371 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  72.07 
 
 		 373 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  69.19 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  65.5 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  60.72 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  56.41 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  56.13 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  59.28 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  60.34 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  57.7 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  61.38 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  65.2 
 
 		 382 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  65.01 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  61.34 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  60.88 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  59.71 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  49.03 
 
 		 374 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  51.27 
 
 		 363 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  51.54 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  47.22 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  46.98 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  48.62 
 
 		 457 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  51.4 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  48.43 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  47.01 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  42.05 
 
 		 379 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  48.15 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  37.8 
 
 		 432 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  37.33 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  34.6 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  36.58 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  34.17 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  33.05 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.52 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  33.71 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  33.42 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  34.66 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  36.75 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  35.23 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  33.15 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  33.81 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  36.29 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  33.89 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  35.41 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  32.1 
 
 		 364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  29.67 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  35.52 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  24.84 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.72 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.02 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  30.77 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  30.05 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  30.67 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  29.52 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.55 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.05 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  29.08 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.91 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  27.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  28.53 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  28.8 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  27.52 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.84 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  28.69 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  27.55 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  34.51 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  32.71 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  37.6 
 
 		 1288 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  36.43 
 
 		 546 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 		 1162 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  22.47 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  30.99 
 
 		 591 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  33.73 
 
 		 439 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  34.35 
 
 		 587 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  29.27 
 
 		 570 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 1400 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  27.13 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  35.77 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  36.97 
 
 		 649 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.17 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  27.09 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1049 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.69 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  21.6 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  32.38 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>