86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0192 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  97.55 
 
 
368 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  85.05 
 
 
370 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  84.78 
 
 
370 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  83.97 
 
 
367 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  81.09 
 
 
365 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  82.05 
 
 
365 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  67.14 
 
 
364 aa  494  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  67.78 
 
 
361 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  67.52 
 
 
362 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  66.38 
 
 
363 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  66.86 
 
 
363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  66.57 
 
 
363 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  62.64 
 
 
432 aa  438  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  57.83 
 
 
366 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  57.95 
 
 
366 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  60.71 
 
 
367 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  63.17 
 
 
375 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  63.17 
 
 
375 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  62.61 
 
 
375 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  50 
 
 
366 aa  348  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  37.33 
 
 
457 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  33.15 
 
 
374 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  36.39 
 
 
363 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  35.57 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  34.92 
 
 
362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  31.07 
 
 
351 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  31.07 
 
 
351 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.87 
 
 
361 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  35.07 
 
 
358 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  33.8 
 
 
363 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  34.69 
 
 
358 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  34.37 
 
 
389 aa  175  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  33.43 
 
 
379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.85 
 
 
376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  36.24 
 
 
393 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  36.22 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.82 
 
 
358 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  33.99 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  34.58 
 
 
386 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  33.99 
 
 
376 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  32.87 
 
 
358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.15 
 
 
382 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  34.06 
 
 
394 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  34.09 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  32.41 
 
 
371 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  32.41 
 
 
366 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  34.06 
 
 
394 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  31.61 
 
 
382 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  31.65 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  31.03 
 
 
382 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  31.37 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.92 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.7 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.88 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.61 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.91 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.03 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.01 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.44 
 
 
361 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.54 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.03 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  24.47 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.52 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.47 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  24.93 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  25.14 
 
 
373 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  23.08 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  24.15 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 
1288 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.65 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  26.11 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.24 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  32.67 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  26.42 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.31 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
405 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.44 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  19.13 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  20.87 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.17 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  20.87 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  33.51 
 
 
546 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  20.94 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>