83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5584 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  65.35 
 
 
372 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  66.38 
 
 
363 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  67.83 
 
 
358 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  67.66 
 
 
358 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  67.36 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  61.47 
 
 
376 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  61.34 
 
 
382 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  61.49 
 
 
386 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  62.75 
 
 
373 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  56.9 
 
 
366 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  54.89 
 
 
371 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  58.33 
 
 
369 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  54.29 
 
 
358 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  51.37 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  56.64 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  50.57 
 
 
351 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  56.34 
 
 
382 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  57.46 
 
 
382 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  49.43 
 
 
351 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  48.7 
 
 
374 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  47.89 
 
 
362 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  47.44 
 
 
363 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  45.78 
 
 
359 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  46.07 
 
 
363 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  45.58 
 
 
457 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  42.46 
 
 
361 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  43.8 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  43.52 
 
 
393 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  39.31 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  43.52 
 
 
394 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  33.8 
 
 
361 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  33.15 
 
 
368 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  33.15 
 
 
368 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  32.68 
 
 
363 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  33.24 
 
 
364 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  32.37 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.05 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  32.52 
 
 
370 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  32.39 
 
 
363 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  31.72 
 
 
370 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  32.96 
 
 
367 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  31.93 
 
 
366 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  31.65 
 
 
366 aa  179  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  33.14 
 
 
365 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  31.89 
 
 
432 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  34.35 
 
 
367 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  35.25 
 
 
365 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  35.64 
 
 
375 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  34.64 
 
 
375 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35.44 
 
 
375 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.06 
 
 
366 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.97 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.03 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.2 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.12 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.74 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.98 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.85 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.07 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.58 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  26.7 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  28.73 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  26.4 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.89 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.16 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  26.98 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.54 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  26.98 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  24.3 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  24.68 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
1162 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  29.84 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.72 
 
 
353 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  26.32 
 
 
558 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  21.37 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  21.37 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  28.4 
 
 
816 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  24.62 
 
 
322 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
369 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
1737 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>