84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0191 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  98.36 
 
 
366 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  78.98 
 
 
376 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  78.14 
 
 
373 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  76.67 
 
 
369 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  69.64 
 
 
382 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  71.14 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  58.24 
 
 
363 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  56.61 
 
 
351 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  59.49 
 
 
389 aa  391  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  56.32 
 
 
351 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  61.92 
 
 
382 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  60.47 
 
 
382 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  54.93 
 
 
372 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  58.43 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  60.67 
 
 
382 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  57.02 
 
 
358 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  59.35 
 
 
358 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  59.64 
 
 
358 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  54.89 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  49.72 
 
 
374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  49 
 
 
362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  50.42 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  46.78 
 
 
457 aa  295  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  48.03 
 
 
363 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  45.28 
 
 
361 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  47.9 
 
 
363 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  47.06 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  44.72 
 
 
379 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  47.49 
 
 
394 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  45.38 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  33.89 
 
 
361 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  35.11 
 
 
363 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.29 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  34.81 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  34.93 
 
 
363 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  34.32 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.32 
 
 
370 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.65 
 
 
363 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  32.08 
 
 
362 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  34.53 
 
 
367 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  33.15 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  35.38 
 
 
367 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  33.43 
 
 
368 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.05 
 
 
366 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  34.67 
 
 
365 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.9 
 
 
366 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.62 
 
 
366 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  35.44 
 
 
375 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  35.03 
 
 
375 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  35.08 
 
 
375 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  34.27 
 
 
365 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.49 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  29.01 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.61 
 
 
368 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  28.18 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  27.79 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.65 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  29.95 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.43 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  29.22 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.6 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  28.88 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  28.1 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.32 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.9 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  32.29 
 
 
558 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  31.86 
 
 
569 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.47 
 
 
361 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.63 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  35.45 
 
 
649 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  28.48 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  28.25 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
1288 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  26.18 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.32 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  26.13 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  28.07 
 
 
570 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  25.76 
 
 
1049 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.36 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>