74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0421 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  782    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  46.51 
 
 
1288 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  31.27 
 
 
369 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  24.63 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  37.5 
 
 
649 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  28.77 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
673 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  37.8 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  28.67 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
1162 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  32.93 
 
 
569 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.43 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  33.33 
 
 
591 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  30.4 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  34.52 
 
 
558 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  27.91 
 
 
331 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30.15 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  27.33 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  28.24 
 
 
1049 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  27.33 
 
 
331 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25.87 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  32.38 
 
 
331 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  27.81 
 
 
638 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  32.38 
 
 
331 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  29.73 
 
 
353 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  24.28 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  31.72 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  23.85 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  34 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  27.42 
 
 
388 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  28.47 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.19 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  24.39 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  28.47 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.65 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  27.59 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  29.03 
 
 
621 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  26.14 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  27.78 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.94 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  30.1 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  29.52 
 
 
810 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  21.43 
 
 
426 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  30.3 
 
 
525 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  30.07 
 
 
365 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49883  predicted protein  32.38 
 
 
554 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0580309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  33.04 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  27.34 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.74 
 
 
432 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  27.27 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  38.89 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.57 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  30.99 
 
 
171 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  27.78 
 
 
448 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  30.48 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  32.58 
 
 
348 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  24.56 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  28.85 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  21.71 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  28.04 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  30.84 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
1087 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  29.7 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  26.89 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  27.83 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  26.89 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
1103 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  32.26 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  30.56 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  29.63 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 
1737 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  28.28 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  28.4 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  30.84 
 
 
457 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>