55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3032 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1055    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  32.57 
 
 		 558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  30.31 
 
 		 570 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.89 
 
 		 649 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  30.97 
 
 		 591 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  31.79 
 
 		 569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  32.16 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  28.89 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  30.64 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  29.85 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  27.01 
 
 		 490 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.71 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  29.14 
 
 		 588 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  23.45 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  34.5 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.63 
 
 		 672 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  35.96 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  36.79 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  21.78 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.14 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  31.25 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.09 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  21.17 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  27.27 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  38.39 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  20.59 
 
 		 331 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  20.59 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  20.24 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 1162 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  20.58 
 
 		 331 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.88 
 
 		 379 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  34.55 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.3 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  27.56 
 
 		 868 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  27.14 
 
 		 348 aa  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  25.68 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  28.04 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 1288 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  40 
 
 		 629 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  36.94 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  23.65 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  31.93 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  31.46 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  30.53 
 
 		 641 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  35.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  36.61 
 
 		 370 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  30.48 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  31.09 
 
 		 394 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  31.09 
 
 		 394 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  37.25 
 
 		 362 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  38.94 
 
 		 370 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>