74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0099 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  100 
 
 
558 aa  1134    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  49.04 
 
 
569 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  47.54 
 
 
570 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  51.34 
 
 
591 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  49.43 
 
 
649 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  43.12 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  32.57 
 
 
525 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  30.57 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  25 
 
 
395 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  24.71 
 
 
394 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  29.77 
 
 
579 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  27.27 
 
 
620 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.36 
 
 
331 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  23.28 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  23.06 
 
 
331 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.01 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.51 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  27.94 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  26.73 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.58 
 
 
333 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
1162 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.68 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.93 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.47 
 
 
672 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  36.94 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  36.36 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  28.95 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
1288 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  34.52 
 
 
377 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1065  hypothetical protein  24.8 
 
 
412 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.45 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
673 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  29.2 
 
 
171 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  31.78 
 
 
424 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  27.19 
 
 
362 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  30.72 
 
 
366 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  30.77 
 
 
376 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  27.66 
 
 
457 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  28.32 
 
 
388 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30.63 
 
 
442 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  32.11 
 
 
322 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  23.35 
 
 
332 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  27.01 
 
 
283 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  28.95 
 
 
638 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  27.5 
 
 
1049 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  32.39 
 
 
352 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  28.97 
 
 
363 aa  51.6  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  27.86 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  27.18 
 
 
348 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  28.95 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  29.41 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  27.59 
 
 
868 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  35.29 
 
 
363 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  28.89 
 
 
317 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.14 
 
 
362 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  30.97 
 
 
379 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  27.55 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  34.78 
 
 
382 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  29.73 
 
 
367 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  31.16 
 
 
370 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  29.91 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  28.05 
 
 
369 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  29.36 
 
 
358 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  29.57 
 
 
587 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  34.91 
 
 
448 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  24.77 
 
 
372 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  30.43 
 
 
370 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  29.17 
 
 
363 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  28.97 
 
 
394 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  26.85 
 
 
351 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  28.97 
 
 
394 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  29.31 
 
 
363 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>