20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0539 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1174    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  40.89 
 
 
604 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  43.55 
 
 
620 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  36.99 
 
 
490 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  33.89 
 
 
579 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  29.47 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  29.14 
 
 
525 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  26.67 
 
 
569 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  27.84 
 
 
649 aa  87  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.94 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  26.33 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  25.87 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  22.4 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  23.78 
 
 
333 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  22.35 
 
 
331 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  20 
 
 
395 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  23.04 
 
 
331 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  22.92 
 
 
331 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  24.71 
 
 
331 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  19.24 
 
 
394 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>