74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0250 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  55.57 
 
 		 570 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  100 
 
 		 649 aa  1306    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  61.91 
 
 		 569 aa  717    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  49.11 
 
 		 591 aa  551  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  50 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  38.57 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  32.67 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  29.08 
 
 		 604 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  28.42 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  29.81 
 
 		 579 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.64 
 
 		 395 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  27.84 
 
 		 588 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  23.37 
 
 		 394 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  33.9 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  21.97 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1162 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 1288 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.04 
 
 		 672 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  37.17 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  30.33 
 
 		 325 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  31.15 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  31.15 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  39.09 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  31.15 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  30.33 
 
 		 331 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  29.03 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  39.77 
 
 		 638 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  31.07 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  27.21 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.94 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  30.91 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.21 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  30.16 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  34.71 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  27.21 
 
 		 694 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  33.12 
 
 		 432 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  32.53 
 
 		 369 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.09 
 
 		 868 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  33.98 
 
 		 362 aa  55.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 1737 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  30.2 
 
 		 361 aa  55.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 673 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  33.06 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  32.64 
 
 		 363 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  31.73 
 
 		 457 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  30.56 
 
 		 376 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  32.26 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  37.27 
 
 		 448 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1065  hypothetical protein  30.4 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  32.26 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  33.9 
 
 		 641 aa  53.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.13 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  27.08 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  30.56 
 
 		 363 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 1400 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  26.57 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  28.45 
 
 		 374 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.56 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  29.86 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  29.58 
 
 		 362 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  25.87 
 
 		 366 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  32.11 
 
 		 363 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  32.65 
 
 		 367 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  31.82 
 
 		 352 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  28.12 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  27.27 
 
 		 348 aa  45.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  28.95 
 
 		 322 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  27.56 
 
 		 372 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  34.58 
 
 		 546 aa  44.3  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  32.41 
 
 		 587 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  27.78 
 
 		 325 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>