19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0922 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1174    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  36.56 
 
 
546 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
673 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  29.3 
 
 
348 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  27.93 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  30.34 
 
 
333 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  28.45 
 
 
1049 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  27.64 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  28.05 
 
 
332 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  30.08 
 
 
457 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
1162 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  37.23 
 
 
283 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  37.36 
 
 
432 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  35.23 
 
 
374 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  25.89 
 
 
362 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  29.57 
 
 
558 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  31.96 
 
 
621 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  25.1 
 
 
641 aa  43.5  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  32.22 
 
 
570 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>