52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0627 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  887    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0892  hypothetical protein  28.61 
 
 
457 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.986479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
673 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  31.25 
 
 
333 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  29.37 
 
 
1049 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  31.51 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1664  hypothetical protein  28 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.203234  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
1162 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1954  hypothetical protein  26.71 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.222672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0922  hypothetical protein  27.89 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.579044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1679  hypothetical protein  27.6 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  20.95 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  33.73 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  33.73 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
1288 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
1087 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  24.19 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  28.14 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.21 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4812  hypothetical protein  27.59 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4940  hypothetical protein  27.59 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4989  hypothetical protein  26.9 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  28.24 
 
 
741 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  27.78 
 
 
739 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  28.24 
 
 
738 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  26.73 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0528  hypothetical protein  26.85 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0728399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0532  hypothetical protein  30.71 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25.24 
 
 
283 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66120  hypothetical protein  26.25 
 
 
318 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.96 
 
 
370 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4988  hypothetical protein  29.92 
 
 
318 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  28.8 
 
 
442 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  25.21 
 
 
362 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  21.3 
 
 
317 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  28.74 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1217  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0362621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  25.95 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5736  hypothetical protein  26.42 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  25.38 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  28.24 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  30.11 
 
 
283 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1940  hypothetical protein  22.99 
 
 
331 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  28.24 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0636  hypothetical protein  22.94 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  23.12 
 
 
374 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  23.02 
 
 
368 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>