77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2074 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  757    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  88.4 
 
 
370 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  72.58 
 
 
375 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  70.05 
 
 
375 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  70.79 
 
 
373 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  71.06 
 
 
373 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  62.22 
 
 
369 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  61.94 
 
 
369 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  63.06 
 
 
369 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  61.31 
 
 
376 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  59.04 
 
 
376 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  62.01 
 
 
361 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  61.73 
 
 
361 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  61.73 
 
 
361 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  57.3 
 
 
376 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  57.1 
 
 
376 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  54.27 
 
 
368 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  53.99 
 
 
368 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  47.03 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  74.59 
 
 
439 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  30.19 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  27.42 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  26.87 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  27.25 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  26.63 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  28.27 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  27.91 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  29.5 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  25.98 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  27.85 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  28.46 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  26.68 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  27.73 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  30.67 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  27.01 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  27.93 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  28.31 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  26.13 
 
 
432 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  29.22 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  23.76 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  26.7 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  27.66 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.13 
 
 
362 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  30.43 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  23.41 
 
 
361 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  27.14 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  26.81 
 
 
366 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  30.43 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  26.2 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  27.23 
 
 
363 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  25.65 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  26.81 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  28.42 
 
 
367 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  28.98 
 
 
375 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  29.52 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  28.35 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  28.91 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  29.82 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  25.07 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  25.94 
 
 
366 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  28.05 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  25.8 
 
 
372 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  26.79 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  27.84 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  26.23 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  24.94 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  25.96 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  26.16 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  22.77 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1162 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  24.53 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  25.41 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  25.14 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  29.47 
 
 
546 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.14 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>