84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2426 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  86.43 
 
 		 358 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  86.73 
 
 		 358 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  67.51 
 
 		 363 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  63.35 
 
 		 372 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  67.62 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  62.94 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  58.86 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  54.31 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  61 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  61.76 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  60.59 
 
 		 382 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  61.22 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  59.04 
 
 		 371 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  53.45 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  59.04 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  60.68 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  55.52 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  59.31 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  53.58 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  49.44 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  50.56 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  46.65 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  48.04 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  44.82 
 
 		 457 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  43.21 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  45.24 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  42.7 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  46.54 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  46.41 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  46.24 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  36.31 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  34.46 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  36.87 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  35.21 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  34.97 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  36.91 
 
 		 432 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  34.93 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  34.93 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  35.69 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  34.99 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  34.96 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  34.69 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  33.62 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  33.89 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  37.39 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  38.05 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  33.62 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  36.62 
 
 		 375 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  38.02 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  37.81 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  29.56 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25.61 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.13 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.95 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.17 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.46 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  26.92 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.13 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.13 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.25 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  24.66 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.9 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  28.27 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  28.99 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 1162 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.95 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.26 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  25.4 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  23.64 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  21.79 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 1288 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  24.67 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.63 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  24.26 
 
 		 357 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  28.32 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  26.49 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  24.55 
 
 		 694 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>