83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1317 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  83.97 
 
 
368 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  85.05 
 
 
368 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  80.71 
 
 
370 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  79.89 
 
 
370 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  79.6 
 
 
365 aa  534  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  82.3 
 
 
365 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  66.67 
 
 
362 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  67.04 
 
 
361 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  65.24 
 
 
364 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  64.79 
 
 
363 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  66.19 
 
 
363 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  64.79 
 
 
363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  61.71 
 
 
432 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  63.82 
 
 
367 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  58.07 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  57.51 
 
 
366 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  62.78 
 
 
375 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  62.5 
 
 
375 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  62.22 
 
 
375 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  49.16 
 
 
366 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  34.27 
 
 
374 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  37.47 
 
 
363 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  38.38 
 
 
359 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  36.41 
 
 
457 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  35.98 
 
 
362 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  33.51 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  30.64 
 
 
351 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  38.15 
 
 
363 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  30.59 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  34.5 
 
 
389 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  35.87 
 
 
393 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  34.05 
 
 
379 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  34.2 
 
 
358 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  34.28 
 
 
358 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  35.39 
 
 
376 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  32.77 
 
 
363 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.16 
 
 
372 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  35.62 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.65 
 
 
376 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  35.39 
 
 
373 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  34.87 
 
 
386 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  32.87 
 
 
358 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  33.8 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.8 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.34 
 
 
394 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  34.59 
 
 
382 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  33.79 
 
 
369 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  31.9 
 
 
382 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  32.38 
 
 
382 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  31.32 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.51 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.34 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  26.82 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  28.5 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  27.99 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.92 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  26.28 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.94 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.49 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.67 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.49 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.14 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  23.14 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.56 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.15 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  26.95 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.23 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.61 
 
 
368 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.44 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  19.43 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  32.97 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
1288 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.05 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  25.74 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  29.73 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  29.71 
 
 
591 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.07 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  29.68 
 
 
569 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  20.78 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>