91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2427 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  91.74 
 
 		 363 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  91.74 
 
 		 363 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  71.19 
 
 		 361 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  68.86 
 
 		 362 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  68.04 
 
 		 364 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  66.38 
 
 		 368 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  64.8 
 
 		 370 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  66.48 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  66.95 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  66.38 
 
 		 365 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  64.79 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  66.85 
 
 		 365 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  62.68 
 
 		 432 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  63.69 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  57.55 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  56.98 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  62.08 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  62.93 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  62.36 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  49.86 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  36.54 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  38.97 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  41.1 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  32.18 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  36.99 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  32.95 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.96 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  32.38 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  34.97 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  34.53 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  34.88 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  35.34 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  34.9 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  34.9 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  34.56 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  35.43 
 
 		 386 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  32.13 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  31.73 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  33.71 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  33.63 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  34.82 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  37.29 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  35.09 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  34.82 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  33.54 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  32.56 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  35.38 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  35.09 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  35.39 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  33.62 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  35.11 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  28.75 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.56 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  30.67 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  30.67 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  27.15 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  30.08 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  25.41 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  26.75 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  26.49 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  26.86 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  27.01 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.03 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  29.17 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  26.92 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  26.02 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.75 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  29.31 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  26.26 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.82 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.1 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.66 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.23 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.11 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  26.4 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  26.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  27.03 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 1288 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  20.88 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  34.18 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.04 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  21.8 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  21.8 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  21.8 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.22 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 1038 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.95 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  29.17 
 
 		 558 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3683  hypothetical protein  30.4 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.503578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>