82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0517 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  98.37 
 
 		 369 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  87.53 
 
 		 369 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  70.36 
 
 		 376 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  68.16 
 
 		 376 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  65.68 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  56.52 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  61.22 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  62.22 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  61.22 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  60.94 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  60.5 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  60.33 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  59.5 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  60.33 
 
 		 375 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  60.11 
 
 		 373 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  55.98 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  60.29 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  47.96 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  65.17 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  28 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  25.27 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  27.58 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  28.53 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  24.73 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  28.31 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  25.4 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  27.3 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  27.3 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  25.52 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  27.01 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.6 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  25.52 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  26.28 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  28.72 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  26.03 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  26.76 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  26.49 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  28.62 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  25.66 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  26.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  25.82 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  26.7 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  26.34 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  27.74 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  24.41 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  27.64 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  25.53 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  25.15 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  29.46 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  25.26 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  27.49 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  29.46 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  25.99 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  25.23 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  25.79 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  27.66 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  24.93 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  33.85 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.6 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  33.09 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  26.2 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  24.94 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  33.09 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  31.84 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  27.99 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  27.43 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  25.21 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 1162 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 		 673 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  25.94 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1049 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  22.77 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  22.02 
 
 		 1176 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>