92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1689 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  94.81 
 
 		 366 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  749    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  63.64 
 
 		 432 aa  461  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  63.22 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  58.87 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  61.98 
 
 		 375 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  59.14 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  57.83 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  58.57 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  58.07 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  57.31 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  56.53 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  57.95 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  57.55 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  63.19 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  60.88 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  56.29 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  57.43 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  57.67 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  58.81 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  52.81 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  35.85 
 
 		 457 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  37.96 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  34.47 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  32.49 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  31.83 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  36.1 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  33.15 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  32.68 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  34.95 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  32.61 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  32.68 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  32.22 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  33.9 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  34.38 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  34.17 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  35.34 
 
 		 393 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  33.14 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  33.04 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  32.59 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  31.65 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.64 
 
 		 379 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  32.14 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  34.25 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  33.13 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  32.92 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  33.43 
 
 		 382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  31.27 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  33.72 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  31.08 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  33.14 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  33.7 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  26.25 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.98 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.49 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  28.3 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  28.11 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25.93 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  26.98 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.28 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.01 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.46 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  24.4 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.05 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.36 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  25.58 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  20.75 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  30.3 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  27.03 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  20.81 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  20.81 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  29.29 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  25.79 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  26.27 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  29.5 
 
 		 569 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.74 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  20.63 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  20.38 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  20.75 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  36.14 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  25.14 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  27.89 
 
 		 591 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  29 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  26.57 
 
 		 649 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  39.19 
 
 		 546 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  24.8 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.4 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  25.35 
 
 		 638 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>