67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1257 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  100 
 
 
591 aa  1225    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  51.62 
 
 
570 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  52.5 
 
 
569 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  49.27 
 
 
649 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  51.34 
 
 
558 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  39.4 
 
 
394 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  30.71 
 
 
525 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  29.66 
 
 
579 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  27.34 
 
 
604 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  23.38 
 
 
395 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  23.48 
 
 
394 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.86 
 
 
672 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  29.33 
 
 
620 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  22.69 
 
 
325 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  27.08 
 
 
490 aa  87  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  22.93 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  25.87 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  37.5 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  39.47 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
1162 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  35.96 
 
 
638 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  32.26 
 
 
331 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  32 
 
 
331 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  31.45 
 
 
331 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  31.45 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  31.2 
 
 
331 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  34.23 
 
 
442 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  40.51 
 
 
1288 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  30.6 
 
 
333 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
673 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.264494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  29.09 
 
 
388 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  36.11 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  36.43 
 
 
448 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
1400 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  30.56 
 
 
353 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  31.07 
 
 
318 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.3 
 
 
868 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  32.99 
 
 
322 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  31.54 
 
 
379 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  33.33 
 
 
1049 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1105  hypothetical protein  28.87 
 
 
332 aa  53.9  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1065  hypothetical protein  22.03 
 
 
412 aa  53.9  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
1103 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
1737 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  29.2 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  27.47 
 
 
171 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  31.16 
 
 
694 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
1087 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  31.33 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  36.9 
 
 
361 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  33.04 
 
 
359 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  27.98 
 
 
362 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.34 
 
 
621 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.95 
 
 
362 aa  47.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  31.48 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  30.5 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  27.89 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  29.71 
 
 
367 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  30.56 
 
 
394 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  30.26 
 
 
546 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0776  hypothetical protein  20.27 
 
 
405 aa  45.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  30.56 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  32.38 
 
 
457 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6226  hypothetical protein  28.44 
 
 
613 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.08261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  21.77 
 
 
325 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>