78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3201 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  100 
 
 
395 aa  829    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  98.99 
 
 
394 aa  815    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  27.22 
 
 
394 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  25 
 
 
558 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  23.36 
 
 
570 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  23.64 
 
 
649 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  23.16 
 
 
591 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  22.71 
 
 
569 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3032  hypothetical protein  23.32 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.05 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  21.54 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
673 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.26 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  36.19 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3488  hypothetical protein  21.54 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  26.55 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  26.55 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  22.56 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  28.67 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  30.82 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  30.97 
 
 
353 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2327  hypothetical protein  22.19 
 
 
579 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
1288 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
1162 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  19.72 
 
 
672 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  30.65 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  33.61 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  29.84 
 
 
375 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  33.04 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  33.61 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  32.5 
 
 
442 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  23.7 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  32.26 
 
 
1049 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  30.43 
 
 
385 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  29.46 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  28.83 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0984  hypothetical protein  22.04 
 
 
604 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.160952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  29.46 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  28.23 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  30.57 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  31.48 
 
 
638 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3199  hypothetical protein  20.83 
 
 
620 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.08247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  30.58 
 
 
435 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  28.57 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  23.58 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0539  hypothetical protein  20 
 
 
588 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.221808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  33.73 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  26.55 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  25.87 
 
 
348 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  24.67 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  25.58 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  26.67 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  19.94 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  25.44 
 
 
325 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  30.7 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
1737 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  25.44 
 
 
325 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  25 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
1103 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13961  hypothetical protein  22.88 
 
 
171 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.013053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  28.38 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  26.24 
 
 
283 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  26.4 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  26.61 
 
 
868 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  27.91 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0145  hypothetical protein  27.56 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0300  CgeB family protein  31.62 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  23.89 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  29.66 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  24.83 
 
 
621 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0963  hypothetical protein  29.57 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  26.92 
 
 
810 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0206  hypothetical protein  35 
 
 
333 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0200054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1728  protein CgeB  25.88 
 
 
325 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  23.61 
 
 
457 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>